Тяжёлый труд в эвакуации подорвал здоровье Александра Георгиевича Калягина и привёл к разрыву сердца. Могила Калягина находится на малмыжском кладбище, являясь своеобразным памятником всем сотрудникам МОПИ, павшим на фронте и в тылу в период войны. В эвакуации в Малмыже у Александра Георгиевича и его супруги, сотрудницы МОПИ, преподавателя французского языка Юлии Мироновны Зайдеман родился сын Александр. Калягин-старший умер, когда тому не было и месяца от рождения. Впоследствии Александр Александрович, сын преподавателей МОПИ первого призыва, станет знаменитым актёром. Всесоюзную славу ему принёс фильм «Здравствуйте, я ваша тётя!». В настоящее время Александр Александрович Калягин является председателем Союза театральных деятелей РФ. Он часто приезжает в Малмыж на могилу отца.
В Малмыж были эвакуированы не только МОПИ, но и некоторые другие педагогические вузы – Московский государственный педагогический институт имени В.И. Ленина, Педагогический институт имени К. Либкнехта, Дефектологический институт. Возникла необходимость их объединения в рамках единой управленческой структуры. Этим слиянием диктовалось решение о назначении на пост директора малмыжского кластера доцента МГПИ Николая Ивановича Молодых. Прежний директор МОПИ, старший преподаватель А.Г. Калягин перемещался на пост руководителя парткома, являясь одновременно деканом исторического факультета.

Но ­всё-таки подавляющее большинство малмыжских эвакуированных студентов и преподавателей принадлежали МОПИ. И в скором времени возобладала идея реорганизации вузов на его основе. Решением Наркомпроса объединённое высшее учебное заведение в Малмыже стало именоваться: Московский областной педагогический институт.
Среди известных выпускников МОПИ периода войны — видный советский литературовед и литературный критик Александр Иванович Овчаренко. Окончив вуз в 1942 году, он ушёл на фронт, а демобилизовавшись, продолжил обучение в аспирантуре.
Новым директором МОПИ ещё в малмыжский период его истории становится Яков Николаевич Надеждин. Член ВКП(б) с 1927 года, до войны он окончил Институт народного образования и Коммунистический институт. Работал в структурах СНК РСФСР по направлению просвещения. Уже после МОПИ он будет в июле 1945 года направлен в Германию в качестве инспектора по профессионально-­техническому образованию. Работал в структуре образования в зоне Советской военной администрации в Германии. В созданной в ГДР высококлассной образовательной системе — немалый вклад бывшего директора МОПИ Я. Н. Надеждина. По проблеме развития профессионального образования в ГДР им будет впоследствии защищена кандидатская диссертация.

Приказом Народного комиссариата просвещения от 3 августа 1944 года новым директором МОПИ была назначена кандидат исторических наук Антонина Васильевна Мамонтова. Решающую роль в проведённой замене директора сыграло, по-видимому, требование наличия учёной степени. В пользу этой версии говорит, в частности, отчёт Мамонтовой конца календарного 1944 года, в котором выносилось замечание Я. Н. Надеждину, что кандидатская диссертация не была им подготовлена в срок надлежащим образом. Яков Николаевич тем не менее продолжал ещё некоторое время свою трудовую деятельность в МОПИ. На Антонину Васильевну Мамонтову обрушился между тем груз проблем, важнейшей из которых являлась проблема размещения института.
До занятия директорской должности Антонина Васильевна Мамонтова преподавала на кафедре марксизма-­ленинизма. По-видимому, Антонина Васильевна тяжело болела, о чём свидетельствует приказ о возложении исполнения обязанностей в связи с её болезнью на заместителя — А. И. Козаченко.
В докладных записках, направленных руководству Москвы и Московской области, директор МОПИ А. В. Мамонтова сообщала о непригодности здания в Новокирочном переулке для нормальной организации учебного процесса — «не проведён газ, технический ток, отсутствует специальная вентиляция».
Институт был вынужден арендовать помещения лабораторий. Так, физико-­математический факультет пользовался в учебных целях физической лабораторией МГУ. Руководство МОПИ добивалось пересмотра решения Комитета по делам высшей школы о выселении его из здания в Подсосенском переулке, занятого Инженерно-­экономическим институтом имени С. Орджоникидзе. При невозможности возвращения в Подсосенский переулок директор Мамонтова ставила вопрос о строительстве для МОПИ нового здания.
С 15 мая 1945 года новым директором МОПИ становится литературовед, имевший за плечами боевой опыт на фронтах Великой Отечественной, Фёдор Харитонович Власов. До войны он был деканом литературного факультета, читал курсы теории литературы, русской литературы XX века, современной литературы. Дважды Фёдор Харитонович избирался секретарём партийной организации института. Одновременно он возглавлял критико-­библиографический отдел журнала «Новый мир», редактировал журнал «Молодая гвардия». Уйдя на фронт в июле 1941 года, Фёдор Харитонович участвовал в обороне Москвы, взятии Кёнигсберга, войне с Японией, был ранен, получил многочисленные награды, включая Орден Красной Звезды, Орден Красного Знамени, Ордена Отечественной войны обеих степеней. Начав с комиссара отдельной мотострелковой бригады, он дошёл до должностей заместителя начальника политотдела Западного фронта, начальника политотдела 5‑й армии и начальника тыла армии по политической части. Демобилизовавшись, он по представлению высших органов власти СССР утверждается директором (ректором) МОПИ. Параллельно Фёдор Харитонович руководил кафедрой советской литературы. Именно при нём и в значительной мере при его заслугах МОПИ в 1947 году переезжает по адресу улица Радио, дом 10а. Критическая проблема размещения была на данном этапе решена.
В поисках здания для размещения вуза пришлось даже обратиться к члену Политбюро ЦК Андрею Александровичу Жданову, курировавшему тогда вопросы идеологии. Вмешательство Жданова и имело решающее значение в том, что по сей день МГОУ размещается по своему уже традиционному адресу.